TOP 10 des meilleurs logiciels de comptabilité !

Vous savez ce qu’on dit : « La comptabilité, c’est compliqué ». Il y a du vrai dans cette formule.

Combien d’entrepreneurs enthousiastes finissent par déchanter face à la complexité de la gestion courante des tâches comptables ? Celles-ci sont obligatoires, indispensables pour piloter la croissance de son entreprise… et affreusement complexes.

C’est pourquoi, pendant fort longtemps, les dirigeants se sont reposés (avec soulagement) sur l’expertise des professionnels de la compta.

Une solution efficace, certes, mais coûteuse et limitée : impossible d’avoir une vision concrète, en temps réel, de la situation financière de l’entreprise.

Ce qui, dans un marché toujours plus concurrentiel, où la réactivité est la clé de la compétitivité, peut faire toute la différence entre la réussite et l’échec.

Heureusement, l’évolution technologique a changé la donne. Innovants, efficients, boostés par l’automatisation, riches en fonctionnalités pertinentes, les logiciels de comptabilité du XXIe siècle aident les entrepreneurs à piloter leur activité au plus près de leurs besoins.

En ce sens, ils font bien plus qu’enregistrer les flux financiers : ils apportent de la valeur et participent à la croissance de l’entreprise, tout en coûtant (beaucoup) moins cher qu’un cabinet comptable.

La seule question est : quel logiciel de comptabilité choisir ? Pour y répondre, nous vous proposons de découvrir notre Top 10 des outils les plus attractifs du marché pour gérer vos comptes professionnels.

Qu’est-ce qu’un logiciel de comptabilité ?

Commençons par un brin de définition. Par « logiciel de comptabilité », on entend un programme informatique permettant d’assurer la tenue de la comptabilité, c’est-à-dire de retranscrire les opérations financières réalisées par une entreprise avec ses clients, ses fournisseurs, ses salariés, ses associés, ses partenaires économiques ou ses organismes de financement.

Néanmoins, les logiciels de comptabilité les plus modernes excèdent très souvent ces besoins de base.

Ils embarquent des fonctionnalités avancées susceptibles de répondre aux besoins spécifiques des entreprises.

Certains vont même jusqu’à intégrer l’ensemble des fonctions et des processus internes : on parle alors de progiciels de gestion intégrés (PGI), pour lesquels la comptabilité est un module parmi d’autres.

Ce type d’outil peut être acquis auprès d’un éditeur, le plus souvent sous la forme d’une licence (temporaire ou définitive), ou bien faire l’objet d’un développement en interne.

Dans les faits, cette seconde option est rarement employée, les organisations préférant s’appuyer sur des services existants conçus par des professionnels et largement utilisés dans le monde entrepreneurial.

Pourquoi utiliser un logiciel de comptabilité ?

Cela nous amène à une question phare : pourquoi avoir recours à un logiciel de comptabilité, alors que le marché regorge de cabinets comptables prêts à mettre leurs compétences au service des dirigeants ?

On peut distinguer deux avantages majeurs : le coût réduit de ce genre d’outil, et sa grande souplesse d’utilisation qui convient au plus grand nombre.

En effet, les logiciels de comptabilité constituent l’option la moins onéreuse pour les petites et moyennes entreprises, mais aussi pour les indépendants qui n’ont pas forcément les moyens de rémunérer un expert-comptable.

Deux à cinq fois moins chers que des professionnels, ces outils permettent de réaliser d’importantes économies.

Par ailleurs, les solutions de comptabilité pour les entreprises brillent par leur souplesse d’utilisation.

Elles servent à simplifier et à automatiser les tâches comptables courantes, et à établir les états financiers, tout en garantissant une gestion sécurisée des comptes.

À tout moment, vous gardez le contrôle sur vos opérations financières et pouvez accéder aux documents dont vous avez besoin.

En outre, la synchronisation avec votre banque professionnelle et la catégorisation automatique des transactions contribuent à réduire à zéro le risque d’erreur de saisie.

Enfin, la variété des offres sur le marché et la flexibilité des solutions accessibles font qu’il est aisé, pour chaque type d’entreprise et quelle que soit sa taille, de trouver chaussure à son pied en la matière.

Le Top 10 des meilleurs logiciels de comptabilité sur le marché

Avant d’entrer dans le vif du sujet, un avertissement : il n’existe pas de « bon » ou de « mauvais » logiciel de comptabilité.

Ces outils ont tous vocation à soutenir les entreprises dans leur gestion comptable quotidienne et à optimiser la saisie des opérations financières – et autant dire qu’ils le font tous très bien.

Néanmoins, des différences se font jour au niveau des fonctionnalités proposées comme de la capacité de l’éditeur à répondre aux besoins particuliers des entreprises selon leur taille.

C’est donc sur ces deux points qu’il faut focaliser vos critères de recherche (mais nous y reviendrons plus bas).

Voyons maintenant quels sont les meilleurs logiciels de comptabilité du marché.

1. SAP

Le Graal des logiciels de comptabilité est une énorme machinerie qui compte plus de 230 millions d’utilisateurs Cloud dans le monde et embarque une centaine de solutions couvrant toutes les fonctions métier.

Oui, il s’agit bien de SAP, la crème de la crème des ERP (enterprise resource planning), employé par les entreprises pour gérer leurs activités quotidiennes à tous les niveaux.

La marque allemande propose un outil complet décliné en une multitude de versions avec des modules adaptés à chaque besoin et à chaque secteur d’activité.

Le module qui nous intéresse ici est le logiciel de gestion financière du groupe. Un outil qui englobe l’ensemble des écritures comptables de ventes et d’achats, automatiquement déversées dans la comptabilité générale via la compta client et/ou fournisseur, en passant par la compta analytique.

Les nombreux avantages de SAP en font incontestablement l’un des meilleurs logiciels de comptabilité : amélioration de la coordination entre les services et départements de l’entreprise, réduction des risques de redondances et des incohérences dans les informations, personnalisation poussée via le choix des modules, compatibilité avec les différents systèmes d’exploitation…

Contrairement à ce que l’on pourrait penser, SAP n’est pas réservé aux très gros acteurs du marché (même s’il est utilisé par des mastodontes comme Coca Cola, Audi ou Huawei).

Les petites et moyennes entreprises peuvent aussi implémenter cet outil dans leur système d’information, soit en optant pour l’outil complet, soit en se concentrant sur le module de comptabilité.

Les tarifs vont de 2 500 à 5 000 € et varient fortement en fonction de la version du logiciel et des modules désirés.

2. SAGE

Sage est un éditeur de logiciels qui propose une gamme de solutions pour les petites, moyennes et grandes entreprises (TPE, PME et ETI).

La gamme des logiciels de comptabilité comprend différents outils capables de répondre à l’ensemble des besoins des dirigeants : comptabilité en ligne, logiciel de facturation, trésorerie, facturation électronique ou encore liasse fiscale.

Le but ? Aider les organisations à automatiser leurs tâches clés afin de gagner du temps et de l’argent, faciliter leur analyse comptable et leurs démarches fiscales, et leur permettre de maîtriser leurs tâches courantes – facturation et suivi, gestion commerciale, saisie des écritures comptables, déclarations de TVA, flux de trésorerie, etc. 

L’intérêt de Sage – et ce qui contribue à le placer sur les plus hautes marches de ce classement des meilleurs logiciels de comptabilité – réside dans son adaptabilité.

L’outil est conçu, en effet, pour s’aligner sur les besoins spécifiques des entreprises en fonction de leur taille. On trouve ainsi, parmi les offres de l’éditeur :

• Une formule dédiée aux petites entreprises soucieuses de gérer leur comptabilité et leur facturation dans le Cloud (Sage Active Essentials).
• Un logiciel pour les organisations qui ont besoin d’une solution de comptabilité avancée (Sage 50 Comptabilité).
• Des solutions plus puissantes destinées aux moyennes et grandes entreprises (Sage 100, Sage Intacct avec IA et Sage X3).
• Et même une plateforme personnalisable réservée aux experts-comptables (Sage for Accountants).

Les tarifs sont à l’avenant : ils varient selon le type de solution choisi, à partir de 19 € par mois pour Sage 50 et de 24,50 € par mois pour Sage Active (et bien au-delà pour les solutions plus complexes).

Enfin, ce logiciel de comptabilité reste facile d’utilisation en vertu d’une ergonomie intuitive, tout en garantissant votre conformité avec la réglementation.

Ce qui en fait une excellente option pour les entrepreneurs de tous bords.

3. EBP

EBP est un logiciel de comptabilité au spectre plus réduit que les outils précédents, mais qui fait son travail tout aussi bien.

Cette solution permet de piloter son business « sans prise de tête » (la promesse est affichée sur la page d’accueil du site ebp.com) et rassemble le nécessaire pour la gestion d’une TPE/PME : comptabilité, facturation, paie, fiscalité et relation client.

En somme, tout ce qu’il faut pour maîtriser sa trésorerie, suivre de près ses indicateurs de performance et améliorer sa productivité.

Parmi les avantages d’EBP :

• automatisation des saisies comptables et des tâches récurrentes pour une plus grande fiabilité des enregistrements comptables ;
• gain en efficacité via des reportings en temps réel ;
• et suivi des mouvements bancaires à venir pour optimiser la gestion de la trésorerie.

À cela, ajoutons une prise en main facilitée, une interface intuitive et personnalisable, et une certification conforme à la loi anti-fraude à la TVA de 2018.

Les prix démarrent à 35,20 € HT par mois et par utilisateur pour l’outil EBP Comptabilité Hubbix, sans engagement.

Un tarif relativement bas qui en fait l’un des logiciels de comptabilité les plus accessibles du marché.

4. CEGID

Si vous vous demandez quels sont les meilleurs logiciels de comptabilité pour les PME, l’une des réponses porte le nom de Cegid.

Cette gamme d’outils répond aux besoins de gestion des petites et moyennes entreprises en ce qui concerne la comptabilité, la finance et la fiscalité.

Vous bénéficiez ainsi d’une solution adaptable qui vous donne une vision consolidée et à jour de votre situation financière. Au passage, vous vous libérez du temps et gagnez en sérénité en réduisant le risque d’erreur et de non-conformité.

Grâce à un accès simplifié à vos données financières, vous vous donnez les moyens de prendre des décisions éclairées à tout moment.

Pour cela, ce logiciel de comptabilité intègre les indicateurs de gestion clés, le suivi des échéances clients et fournisseurs, le paiement en un clic, et l’analyse des coûts (en plus de l’incontournable comptabilité analytique).

Autre avantage notable : Cegid héberge toutes ses données sur des serveurs français certifiés, hors de portée des lois extraterritoriales.

Pour des besoins plus larges, Cegid propose Quadra, un logiciel métier, modulaire et paramétrable qui couvre l’ensemble des fonctions d’organisation : paie, gestion commerciale, gestion interne et ressources humaines, mais aussi ventes, expérience client, retail & distribution, ou encore production & gestion industrielle.

Utilisée par plus de 750 000 clients dans 130 pays, la suite logicielle Cegid dispose d’arguments solides pour convaincre. Quant aux tarifs, ils sont établis sur demande en fonction de vos besoins particuliers et de vos contraintes.

5. INDY

Indy est un logiciel de comptabilité adapté aux indépendants. Adossé à une interface ergonomique, il répond à des besoins spécifiques pour une gestion simplifiée et automatisée de la comptabilité courante des petits acteurs du marché.

Dans ce but, l’outil intègre des fonctionnalités essentielles comme la saisie automatique par synchronisation bancaire, les déclarations automatisées, un tableau de bord assurant un suivi financier en temps réel, et la possibilité de générer des factures à partir d’un template.

La force d’Indy réside sans nul doute dans la qualité de l’accompagnement. Prenant acte de la complexité des obligations comptables pour les indépendants, l’éditeur met à leur disposition une équipe de conseillers réactifs qui répondent aux questions et renvoient à des ressources internes comprenant des articles, des guides et des formations.

Par ailleurs, un système de notification permet à l’utilisateur d’être averti de chaque échéance à venir (comme une déclaration de TVA ou la prochaine clôture fiscale). Le tout, sans aucune compétence comptable nécessaire.

Grâce à Indy, les indépendants peuvent aborder leur compta plus sereinement.

C’est aussi l’un des logiciels de comptabilité les plus abordables du marché, avec une formule gratuite pour les fonctionnalités de comptabilité et une offre premium à 12 HT par mois pour bénéficier de l’automatisation des processus fiscaux.

6. TIIME

Voilà un outil étonnant qui se différencie des autres logiciels de comptabilité par sa focalisation sur une tâche bien particulière : l’émission de factures et de devis au format électronique.

Plus largement, Tiime couvre toutes les étapes des processus visant à faire rentrer de l’argent dans l’entreprise et à suivre la trésorerie.

Une solution qui s’adresse aux PME et aux indépendants en leur proposant une interface intuitive pour gérer leur facturation en toute autonomie.

Ce faisant, Tiime permet de…

• Créer des factures et des devis, ou les personnaliser à partir de modèles existants.
• Automatiser le suivi des paiements et des relances en cas d’impayés.
• Centraliser les finances à partir des différents comptes bancaires professionnels.
• Suivre les transactions en temps réel.
• Gérer les achats et les notes de frais.
• Catégoriser les opérations financières afin de simplifier l’analyse.
• Garantir la conformité avec la réglementation relative à la facturation électronique, sachant que l’émission des factures au format digital sera obligatoire à compter du 1er septembre 2027 pour l’ensemble des entreprises (jusqu’à présent, seules les structures de taille intermédiaire et au-delà sont concernées).

La bonne nouvelle, c’est que l’utilisation de Tiime est gratuite pour la partie gestion des devis et des factures, sans limitation.

Pour bénéficier des fonctionnalités avancées de ce logiciel de comptabilité, il faut passer à la formule Smart qui démarre à 14,99 € HT par mois, incluant un compte professionnel et des outils avancés.

Une version premium à 29,99 € HT par mois intègre la gestion comptable automatisée et le suivi bancaire illimité.

7. DIVALTO

L’éditeur français Divalto propose un logiciel ERP et CRM complet divisé en modules qui sont autant de fonctionnalités essentielles : comptabilité et finances, gestion commerciale, gestion assistée par ordinateur, ressources humaines, etc.

Pensé spécifiquement pour les PME et les ETI, le module de comptabilité et de finances de Divalto se caractérise par sa facilité de saisie et ses processus automatisés, qui permettent de gérer l’ensemble des problématiques avec sérénité… tout en restant simple d’usage.

Ce bouquet fonctionnel vous assiste dans la gestion des financements, accélère vos processus de règlement, et vous aide à suivre en détail vos créances clients.

D’autres fonctionnalités touchent à la comptabilité budgétaire, aux déclarations de TVA, à la gestion des immobilisations, à l’établissement de la liasse fiscale, à la saisie des écritures, ou encore à la comptabilité analytique. Le tout à partir de 29 € HT par mois.

Les avantages de Divalto :

• Une interface unique qui centralise tous les outils de gestion.
• La disponibilité des fonctionnalités en mobilité via une application.
• Des tableaux de bord efficaces et pertinents.
• Une prise en main intuitive.
• Une personnalisation poussée de l’interface.
• Un système de centralisation des informations pour simplifier les collaborations.

En outre, Divalto a récemment intégré l’IA générative dans ses solutions pour optimiser ses performances et aider ses clients à transformer chaque décision en levier de croissance.

Autant dire que sa place dans ce classement des meilleurs logiciels de comptabilité pourrait bien s’élever dans un avenir proche.

8. PENNYLANE

Éditeur français fondé en 2020, Pennylane compte déjà plus de 350 000 abonnés à son logiciel de comptabilité, parmi lesquels des dirigeants, des DAFs et des responsables financiers.

Ce succès est tout sauf usurpé : il repose sur un outil puissant qui propose un service à la fois complet et efficace, pensé pour les TPE, les PME, les indépendants et les associations.

Pennylane permet de centraliser l’ensemble des opérations financières de l’entreprise (ventes et achats), de dialoguer avec son expert-comptable, et de bénéficier de fonctionnalités variées.

En pratique, vous pouvez collecter automatiquement les achats, suivre le statut des dépenses, régler les fournisseurs en un clic, personnaliser les devis et les factures à émettre aux clients, automatiser l’envoi et la relance des créances, et offrir une expérience de paiement optimisée.

Par ailleurs, plus de 200 intégrations sont prévues pour connecter les différents logiciels à l’outil.

Pennylane démarre à 14 € HT par mois pour sa formule Basique, et à 24 € HT par mois pour le pack Essentiel.

9. AXONAUT

Restons en France avec Axonaut, outil de gestion comptable et commerciale développé par deux ingénieurs toulousains, et spécifiquement conçu pour les TPE comprenant entre 1 et 10 salariés.

Ce logiciel de comptabilité reconnu (près de 200 000 utilisateurs) répond aux besoins particuliers des artisans, des agences, des startups, des entreprises de services, des indépendants et même des experts-comptables.

L’éditeur propose une solution clé en main efficiente offrant un excellent rapport qualité-prix, adossée à toutes les fonctionnalités propres à un logiciel de pré-comptabilité.

Vous pouvez émettre des factures et des devis, gérer vos achats et vos dépenses, suivre votre trésorerie, administrer vos notes de frais, et tenir votre comptabilité générale en accord avec vos obligations.

En plus de la gestion des factures et des devis, Axonaut embarque un CRM et des solutions de pilotage de l’activité, de gestion de projets, de ressources humaines, de gestion des stocks et de ticketing.

Ces différentes composantes vous aident à gagner du temps sur votre comptabilité, à booster vos ventes et à optimiser vos performances, tout en sécurisant vos données (celles-ci étant hébergées en France sur des serveurs certifiés).

Le tarif de base est un peu plus élevé que d’autres logiciels de comptabilité (à partir de 69,99 € HT par mois), mais il se réduit à proportion de la durée d’engagement.

10. XERO

Très populaire à l’international, Xero est apprécié pour son interface simple et moderne, ses fonctionnalités évolutives et son écosystème riche en intégrations.

Ce logiciel de comptabilité s’adresse avant tout aux PME en croissance qui envisagent d’étendre leur marché à l’étranger : il embarque la gestion multi-devises (avec mise à jour des taux de change) et automatise les rapprochements bancaires.

Les avantages de Xero :

• Une solution comptable simple, intuitive et pratique.
• L’automatisation de la collecte de documents afin de gagner du temps sur la pré-comptabilité.
• Le maintien d’informations financières fiables et cohérentes, via des mécanismes de synchronisation et des systèmes de rapprochement bancaire.
• L’accompagnement des PME à l’international avec un outil adapté aux normes de nombreux pays et des fonctionnalités dédiées (prise en charge d’une quarantaine de devises, suivi des paiements internationaux, etc.).
• Un prix très abordable : à compter de 2,90 dollars (2,56 €) par mois pour l’offre Starter.

Attention : parmi tous les logiciels de comptabilité exposés dans ce classement, Xero est le seul à ne pas être disponible en français.

Il est donc recommandé de maîtriser l’anglais pour pouvoir l’utiliser à bon escient.

Quelles sont les fonctionnalités d’un logiciel de comptabilité ?

Les logiciels de comptabilité sont avant tout pensés pour permettre aux entreprises d’enregistrer leurs opérations financières et de remplir leurs obligations fiscales (notamment l’établissement d’états financiers en fin d’exercice comptable : bilan, compte de résultat et annexe).

Néanmoins, pour la plupart, ces outils embarquent aussi d’autres fonctionnalités pouvant s’avérer pertinentes en fonction de vos besoins :

• L’émission de factures et de devis.
• Les déclarations automatiques de TVA.
• La gestion des transactions avec les tiers (clients, fournisseurs, partenaires…) via la gestion des comptes généraux et auxiliaires. Cela englobe souvent le suivi des paiements et la gestion des relances.
• La gestion des immobilisations et des amortissements.
• La tenue d’une comptabilité analytique, qui permet de ventiler les dépenses de l’entreprise et d’assurer un contrôle de gestion qualitatif.
• L’export des données vers l’outil d’un expert-comptable externalisé.
• La protection et la sécurisation des données.
• Le suivi de la trésorerie via un tableau de bord.
• La réalisation d’un prévisionnel analytique.

Combien coûte un outil de comptabilité ?

Le prix d’un abonnement à un logiciel de comptabilité dépend de quatre facteurs essentiels :

• les fonctionnalités proposées (et les éventuelles options choisies),
• la technologie d’automatisation embarquée,
• la taille de votre entreprise,
• et l’utilisation que vous en faites (en particulier, le nombre de personnes qui vont s’en servir au sein de l’entreprise).

Dans la grande majorité des cas, les tarifs sont exprimés par mois et par utilisateur. Par exemple, un prix de 20 € HT par mois revient à 288 € TTC pour l’année et pour un unique utilisateur.

Ainsi, le prix moyen d’un logiciel de comptabilité tourne autour de 20 € HT par mois pour une entreprise individuelle, et entre 50 et 200 € HT par mois pour une société.

Vous pouvez aussi trouver des outils entièrement gratuits (comme Indy et Tiime), mais cet usage gracieux est limité à des fonctionnalités spécifiques – ce qui permet de tester les solutions avant d’opter pour un abonnement plus complet.

Comment choisir son logiciel de comptabilité ?

Reste une question importante que vous vous posez certainement à ce stade : comment faire le bon choix parmi cette sélection des meilleurs logiciels de comptabilité ? Quel éditeur mérite que vous lui confiiez les clés de votre gestion commerciale et financière ?

La réponse est tout sauf simple, et nécessite de votre part un travail intense de réflexion. En effet, pour faire un choix pertinent, vous devez tenir compte de plusieurs paramètres :

• La taille de votre entreprise.
• Votre secteur d’activité (dans certains cas, un logiciel spécifique peut s’avérer nécessaire).
• La forme juridique de votre entreprise/société et son régime d’imposition (micro, réel simplifié, réel normal, impôt sur le revenu ou sur les sociétés).
• Les fonctionnalités dont vous avez besoin, y compris lorsqu’elles sont complémentaires à la seule comptabilité.
• L’écosystème des intégrations, afin de connecter la solution aux outils que vous utilisez déjà au quotidien.
• Le nombre d’utilisateurs qui auront accès au logiciel de comptabilité.
• Votre budget.

Par la suite, une fois que vous aurez identifié des logiciels adaptés à vos besoins, il est important de vérifier qu’ils sont compatibles avec votre système d’exploitation.

Par ailleurs, si vous travaillez déjà avec un expert-comptable, nous vous recommandons de choisir votre outil avec sa collaboration : vos données seront transférées de ce logiciel vers celui du professionnel en charge, qui s’occupera de les réviser et d’établir vos états financiers.

Il faut donc que ces solutions soient parfaitement compatibles.

Un dernier conseil avant de conclure : prenez le temps de tester différents logiciels de comptabilité, qu’ils soient ou non inclus dans ce Top 10 des solutions les plus en vue sur le marché.

Pour la plupart, les éditeurs proposent au minimum un essai gratuit limité dans le temps ou caractérisé par un accès restreint aux fonctionnalités.

C’est une excellente manière de vous faire une bonne idée des qualités et des défauts de chaque outil, avant de souscrire un abonnement pour les années à venir.